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Perfil proteómico de sueros de pacientes Mexicanos con Diabetes tipo 2 en relación con su índice de masa corporal
Erik Elvin Gómez Cardona
Ana Paulina Barba de la Rosa
Acceso Abierto
Atribución-NoComercial-SinDerivadas
Diabetes
Obesidad
Biomarcador
DIGE
Suero
MAGPIX
Electroforesis 2D
"La diabetes tipo 2 (DT2) es una crisis global de salud pública que amenaza la economía de todas las naciones, en particular los países en desarrollo. La diabetes es un problema de salud importante porque incrementa el riesgo de enfermedades cardiacas y complicaciones microvasculares como ceguera, falla renal u neuropatía periférica. La DT2 es el producto de la interacción entre factores genéticos y ambientales. Algunos individuos son más propensos a desarrollar esta enfermedad que otros debido a diferencias en su fondo genético, por ejemplo las personas con ascendencia indigeno-mesoamericana tienen el doble de probabilidades que los individuos Europeos. La proteómica es una poderosa herramienta que permitirá descubrir biomarcadores relacionados a diabetes que a su vez tengan conexión con variables como obesidad, etnicidad, edad y género. Por esto, el objetivo del presente estudio fue analizar el perfil proteómico de suero de pacientes Mexicanos con diabetes en relación con su índice de masa corporal. Los pacientes se agruparon de acuerdo a su índice de masa corporal en las categorías: Normopeso, Sobrepeso, Obesidad I, Obesidad II/III y un grupo control de voluntarios sanos. Se colectaron muestras de sangre de todos los grupos y las proteínas abundantes de suero fueron removidas utilizando columnas de afinidad MARS14. Las proteínas abundantes y no abundantes fueron recolectadas para su marcaje con CyDye. Las proteínas fueron separadas en geles de 24 cm, los cuales fueron escaneados y analizados con el programa DeCyder 2D (v7.2). Las proteínas diferencialmente acumuladas fueron cortadas del gel preparativo, digeridas para su análisis por LC-MS/MS e identificadas utilizando la herramienta de búsqueda MASCOT (v2.5). Se definieron clusters con diferente comportamiento a través de los grupos de estudio y su tendencia fue relacionada a una variante del estudio (proteínas relacionadas a diabetes, obesidad o a ambas) Este estudio presenta evidencia de nuevas proteínas relacionadas a diabetes en suero que no habían sido previamente reportadas por el Proyecto de Proteoma de Diabetes Humano (HDPP), estas proteínas podrían estar relacionadas con las diferencias por etnicidad entre población Europea y Mexicana y representan candidatos a biomarcadores de la enfermedad."
"Type 2 diabetes (T2D) is a global public health crisis that threatens the economies of all nations, particularly developing countries. Diabetes is a major healthcare problem because it increases the risk of heart disease, stroke, and microvascular complications such as blindness, renal failure, and peripheral neuropathy. T2D is the product of the interplay between genetic and environmental factors. Some individuals may be more prone to develop type-2 diabetes, because differences in the genetic backgrounds, for example individuals of mesoamerican-indigenous ancestry have twice risk than those with European ancestry. Proteomics is a powerful tool that will help to find biomarkers related to diabetes that might have a connection with variables such as obesity, ethnic, age and gender. For this, the aim of the present study was to analyze the serum proteomic profile of Mexican patients with T2D grouped on their body mass index. Groups were defined according to the Body Mass Index of each patient into five categories: Normal weight, Overweight, Obese class I, Obese class II/III and one control group formed for healthy persons. Blood samples from all groups were collected under informed consent. Abundant serum proteins were depleted using MARS14 affinity columns. Abundant and non-abundant proteins were collected for labeling with Cyfluorescent dyes for DIGE. Proteins were separated on 24 cm gels and scanned and analyzed with DeCyder 2D differential analysis software (v7.2). Differentially accumulated protein spots were cut from preparative gels, digested for LC-MS/MS analysis and identified using MASCOT (v2.5) search engine tool. Groups with different behavior through the groups were defined and its tendency was related to a variant on the study (Diabetes, Obesity or Diabetes-Obesity related protein). This work presents evidence of new diabetic related proteins in serum that has not been previously reported by the Human Diabetes Proteome Project (HDPP), those proteins might be related to the ethnicity differences between European an Mexican population and represent possible candidate biomarkers for the disease."
2015
Tesis de maestría
BIOLOGÍA MOLECULAR
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