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http://ipicyt.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1010/652| Transcriptómica de la interacción simbiótica Trichoderma virens-Arabidopsis thaliana y generación de mutantes en genes regulados diferencialmente en el hongo | |
| MAGNOLIA ESTRADA RIVERA | |
| J. SERGIO CASAS FLORES | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial-SinDerivadas | |
| Trascriptómica Simbiosis Arabidopsis Biocontrol sm-1 Trichoderma | |
| "Los hongos del genero Trichoderma son microorganismos cosmopolitas ubicuos, que colonizan las raices de la planta, con lo cual incrementan en estas el creciemiento, la resistencia a enfermedades y la tolerancia a estrés abioticos. Hoy en dia son bien conocidos los efectos beneficos que Trichoderma brinda a las plantas; sin embargo, el crecimientpsobre los mecanismos moleculares que median la percepción y reconocimiento del hospedero y que culmina con el establecimeinto de una relacion simbiotica, a la fecha se desconocen. En el presente trabajo reportamos los cambios en la expresión génetica de T.virens en respuesta a la presencia de plántulas de de Arabidopsis thaliana, bajo un enfoquede RNASeq. Los analisis bioinformáticos mostraron una expresión diferencial de 518,236 y 153 genes a las 48 72 y 96 hpi (horas post-inoculación), respectivamente. Las categorias de Gene Ontology que se sobre expresaron en el hongo durante la interacción con la planta corresponden a genes que codifican para proteinas involucradas en el trasporte de cobre y metales (48 y 96 hpi), mientras que las categorias que agrupan genes cuyos productos participan en la organización de los lisosomas, organización de las vacuolas, trasporte de los crabohidratos (48 hpi) y metabolismo de los crabohidratos (48 y 96 hpi) se reprimieron. El trascriptoma de T virens responde y se programa durante las tres etapas que se midieron de la interacción. Los procesos biológicos regulados en Trichoderma durante la interaccion con la planta nos dan una idea de su importancia en la simbiosis y apuntan hacia los posibles mecanismo moleculares empleados por Trichoderma." "Fungi belonging to the Trichoderma genus are ubiquitous cosmopolitan microorganisms that colonize plant roots, which positively impacts in plant growth, resistance to diseases, and tolerance to abiotic stresses. Today, the beneficial effects that T. virens confers to plants are well known; however, the molecular mechanisms that mediate the host perception and recognition, which culminates in the establishment of a symbiotic relationship, are not well known. In this study, we report changes in gene expression of T. virens in response to the presence of Arabidopsis thaliana seedlings, by an RNASeq based approach. The bioinformatic analysis showed differential expression of 518, 236 and 153 genes at 48, 72 and 96 h of coculture with the plant, respectively. Gene Ontology categories that were up regulated in the fungus during its interaction with the plant belong to genes coding for proteins involved in the copper and metal transport (48 and 96 hpi) whereas the categories grouping genes whose products are involved in the vacuoles and lysosomes organization and carbohydrate transport (48 hpi), as well as carbohydrate metabolism (48 and 72 hpi) were repressed. The T. virens transcriptome is reprogrammed during all stages of the interaction. The biological processes regulated in Trichoderma during its interaction with the plant give us an idea of its importance during the symbiosis and point towards the possible molecular mechanisms employed by Trichoderma." | |
| 2014-07 | |
| Tesis de maestría | |
| Español | |
| Público en general | |
| BIOLOGÍA MOLECULAR | |
| Aparece en las colecciones: | Publicaciones Científicas Biología Molecular |
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